Verjetnonajvečja pomanjkljivost čipov DNK je, da so drage ustvariti. Medtem ko so stroški še nekoliko znižala in je verjetno, da še naprej upada ,trenutni stroški oblikovanja čipov DNK je še vedno drago , okoli 100 $. Kot rezultat, le dobro financirane laboratoriji financ za eksperimentiranje s to tehnologijo .
Production Težave
Še eno vprašanje, s čipi DNK je proizvodni težave, povezane . To je predvsem zaradi dejstva, da lahko večina čipi DNA , ki le nekatere proizvajalce s pravo tehnologijo . Kot rezultat , je pogosto težko ali pa traja dolgo časa za dejanske raziskovalci dobiti čipe DNK . Čeprav so proizvodne tehnike izboljšale , je še vedno veliko več za razvoj potrebne, da biproces bolj učinkovit .
Podatkov Napačno
en resen problem, ki se soočajo mnogi raziskovalci preprosto analiziranje podatkov pravilno . Ker je še vedno veliko dela treba opraviti s čipi DNK , to je zelo enostavno znanstveniki napačno razlagajo podatke. To je predvsem zato, ker je tako veliko podatkov o vsakem čipu , in to je pogosto težko ustrezno obdelali vse. Kot rezultat , lahko nepravilni zaključki zlahka pride , kar včasih privede do zavajajočih rezultatov.
Etična dilema
Mordamanj priznana pomanjkljivost jeetična dilema ukvarja s čipi DNK . Medtem ko so ti čipi namenjeni predvsem za razumevanje in preprečevanje bolezni , obstajajo etične meje , ki so pogosto prestopiti . Na primer , lahko čipi DNA pomaga ustvariti brez bolezni ljudi in morda razširiti na naravno življenjsko dobo. Po drugi strani pa bi lahkosvetovna populacija se drastično povečala , kar bi lahko privedlo do prenaseljenosti . To je razlog, zakaj obstaja moralnih zagat --- Tovrstna tehnologija omogoča ljudem , da v bistvu " igrati Boga . "