Preglejte vsebino GC (število G in C ) v vaši primerjem zaporedju . GC vez je močnejša od AT lepljenje zaradi dodatnega vodikove vezi med gvanin in citozin . Optimalno lepljenje je vsaj 50 odstotkov vsebine GC .
2
Preglejte temperaturo kaljenja vaše reakcije . Nizke žarjenje temperature , na splošno opredeljena kot 55 ° C ali manj , lahko povzroči nespecifično vezavo premaza , ki lahko povzroči oligonukleotidov dimere poleg pomnoževanja napačnih genomskih odsekov .
3
Zakonska -Preveri količino in koncentracijo primerji ste ga dodali na PCR. Presežek primerji , ki ponavadi presega 75 picomoles , lahko povzroči oligonukleotidov dimere , kot dobro.